O Museu da Baleia da Madeira (MBM) contempla, logo à nascença, uma dupla faceta, aparentemente contraditória, que concilia caça à baleia e conservação. A sua criação foi proposta à Câmara Municipal de Machico, em 1989, pelo Sr.º Eleutério Reis gerente da EBAM (Empresa Baleeira da Madeira) que viria a tornar-se o primeiro diretor da instituição apelando à proteção dos cetáceos nas águas do arquipélago.
O Museu da Baleia foi formalmente constituído a 26 de Fevereiro de 1990 por deliberação da Câmara Municipal de Machico e é uma instituição permanente, ao serviço da sociedade e do seu desenvolvimento, sem fins lucrativos.
O MBM é, atualmente, um departamento do Município de Machico, localizado na Vila do Caniçal, que narra toda a história da caça à baleia, aborda a diversidade de cetáceos dedicando-se, também, à realização de projetos científicos e à educação.
A história de museu carateriza-se por três etapas principais:
1990 a 2000 – A funcionar no antigo mercado do peixe do Caniçal;
2000 a 2011 – Início dos projetos de investigação científica;
A partir de 2011 – Novo edifício – novo compromisso
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